Thursday, September 29, 2016

Ciliato , ciliato






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ciliato ciliato, o ciliophoran. qualsiasi membro del protozoo phylum Ciliophora, di cui ci sono circa 8.000 specie; ciliati sono generalmente considerati più evoluti e complessi di protozoi. Ciliati sono organismi unicellulari che, a un certo punto nel loro ciclo di vita, possiedono ciglia, brevi organuli simili a capelli utilizzati per la locomozione e la raccolta di cibo. Il battito delle ciglia coordinata spinge protozoi attraverso l'acqua. Enciclopedia Britannica, Inc. Le cilia sono solitamente disposti in righe, detti kineties, sulla pellicola (rivestimento cellulare), ma possono fondere insieme vicino al citostoma (bocca cellule) di alcune specie per formare membranelles o membrane ondulati (vari sheetlike o raggruppamenti ventaglio di ciglia); altrove sulla pellicola, ciglia può formare limblike ciuffi chiamate cirri. La maggior parte dei ciliati hanno una pellicola e contrattili flessibili vacuoli, e molti contengono toxicysts o altri tricociste, piccoli organelli con filettatura o strutture spina-like che possono essere scaricati per l'ancoraggio, per la difesa, o per catturare le prede. Ciliati hanno uno o più macronuclei e da uno a più micronuclei. Le macronuclei controllare le funzioni metaboliche e di sviluppo; i micronuclei sono necessari per la riproduzione. La riproduzione asessuata è in genere, anche se lo scambio sessuale si verifica pure. replica asessuale è di solito da trasversale scissione binaria o per gemmazione. fenomeni sessuali includono coniugazione (genetica scambio tra individui) e autogamia (riorganizzazione nucleare all'interno di un individuo). La riproduzione sessuale non sempre risulta in un aumento immediato del numero; tuttavia, coniugazione è spesso seguita da fissione binaria. Sebbene la maggior parte ciliati sono privi di vita e l'ambiente acquatico, come il Paramecium. molti sono ectocommensals, dimora innocuo sulle branchie o tegumento di invertebrati, e alcuni, come la dissenteria che provocano Balantidium. sono parassiti. Per informazioni su ciliates rappresentativi, vedi peritrichia; spirotrich; suctorian. Più su questo argomento Link esterno stile di MLA: "ciliate". Encyclop & aelig; dia Britannica. Encyclop & aelig; dia Britannica Online. Encyclop & aelig; dia Britannica Inc. 2016. Web. 19 сен. 2016 & lt; https://www. britannica. com/science/ciliate & gt ;. APA stile: ciliato. (2016). In encyclop & aelig; dia Britannica. Estratto da https://www. britannica. com/science/ciliate Chicago Manual of Style: encyclop & aelig; dia Britannica Online. S. v. "ciliate", si accede сентября 19, 2016, https://www. britannica. com/science/ciliate. Queste citazioni sono generati a livello di codice e potrebbero non corrispondere ogni regola di stile di citazione. Fare riferimento ai manuali di stile per ulteriori informazioni. Grazie per il tuo feedback I nostri redattori esamineranno quello che hai inviato, e se soddisfa i nostri criteri, lo aggiungeremo l'articolo. Partecipa Partner Program editoriale di Britannica e la nostra comunità di esperti per ottenere un pubblico globale per il vostro lavoro! Invia questa pagina Quali sono Ciliati? Ciliati sono protisti unicellulari che possono essere riconosciuti per la loro hairlike 'cilia'. Essi li usano per la locomozione e per l'alimentazione. Alcuni ciliati sono molto piccole, non molto più grande il più grande batteri. Altri, come il 'animalcule tromba' Stentor possono raggiungere una dimensione di due millimetri in modo che possa essere visto ad occhio nudo. Paramecium non diventa molto più grande di 0,3 mm. Sotto il centro dell'organismo che si vede l'apertura di alimentazione. Le cilia rendere corrente per spazzare in batteri e altre particelle di cibo. Alla base di aprire il cibo alimentazione è chiuso da un vacuolo. vacuoli alimentari sono utilizzati per trasportare il cibo attraverso la cella. vacuoli contrattili a forma di stella o vescicole acqua espellere vengono utilizzati per bilanciare la quantità di acqua nella cella. Due nuclei portano le informazioni genetiche. Quando si è meno di un millimetro di dimensione del corpo, l'acqua si comporta come uno sciroppo denso così nuotare come un pesce non sarebbe un metodo efficace di locomozione. Se volete nuotare velocemente e con manovrabilità è necessario ciglia, piccoli peli agendo come pale. La maggior parte dei ciliati sono nuotatori eccellenti, alcune specie sono così veloci che sono difficilmente visibili quando osservate. Negli organismi pluricellulari le molte cellule sono specializzate (differenziato). Diversi tipi di cellule sono in grado di eseguire tutti i tipi di compiti (ossia agiscono come cellule nervose, cellule muscolari, cellule di sangue ecc) organismi unicellulari posseggono organelli. strutture speciali all'interno o sulla cellula che aiutano ad eseguire tutti i tipi di compiti. vacuoli alimentari e le vescicole acqua espellendo sono tali organelli. Molti ciliati hanno sviluppato tutti i tipi di organelli molto speciali. Paramecio utilizza i cosiddetti tricociste. minuscoli filamenti appuntiti che possono essere sparati ad un predatore quando si sentono minacciati. Myonemes. sono fibre che agiscono come muscoli. Possiamo vederli nei gambi di animaletti campana come Vorticella e Carchesium. Essi sono in grado di contrarre il gambo con una velocità eccezionale. Nell'immagine destra le myonemes sono visibili come bande ondulate luce all'interno gambi. In molti ciliati ciglia fuse può essere visto. Gruppi di ciglia si fondono in membranelles foglio-like. Come fogli ondulati che spazzano in particelle di cibo. Essi possono essere visti nelle animaletti campana. Altri ciliati hanno fasci tondi di spessore di ciglia chiamati cirri che agiscono come le gambe e consentono l'organismo in realtà camminare su una superficie. Per coordinare questi cirri in modo indipendente hanno organelli nervose simile chiamato neurofibrille. L'immagine in alto di Euplotes e Stylonychia mostra entrambi i tipi di ciglia. Il animalcule tromba Stentor è uno dei più grandi ciliati. Estesa possono essere lungo 2 millimetri e appena visibile ad occhio nudo. Questi stentors verdi mostrano un trucco intelligente diversi altri piccoli organismi utilizzano. Essi sono verdi perché fanno uso di un alghe verdi simbiotico chiamato Chlorella. La pagina su alghe verde mostrerà queste alghe in primo piano. Yildiz Aggiornato Gene Info Documenti recenti Lungo H, Inverno DJ, Chang AY, Sung W, Wu SH, Balboa M, Azevedo RB, Cartwright RA, Lynch M, Zufall RA (2016) tasso basso di mutazione di base sostituzione nel genoma germinale del ciliato Tetrahymena thermophila. biologia del genoma ed evoluzione (): PubMed: 27.635.054 Kaczanowski A, Brunk CF, Kazubski SL (2016) coesione clonale Vita Storia, la senescenza e ringiovanimento indotta da autogamia del rostrata Histophagous Ciliate Tetrahymena. Protist 167 (5): 490-510 PubMed: 27.631.279 Pitsch G, Adamec L, Dirren S, Nitsche F, A imek K, Sirová D, Posch T (2016) The Green Tetrahymena utriculariae n. sp. (Ciliophora, Oligohymenophorea) con il suo endosimbiontica alghe (Micractinium sp.), Vivere in trappole di una pianta acquatica carnivora. Il Journal of microbiologia eucarioti (): PubMed: 27.613.221 Benvenuti a TGD TGD Wiki è un database utenti aggiornabile delle informazioni sulla sequenza del genoma thermophila Tetrahymena determinato presso l'Istituto per Genomic Research (TIGR). TGD Wiki fornisce informazioni sulle genoma, geni e proteine ​​di Tetrahymena raccolte dalla letteratura scientifica, il mondo della ricerca, e molte altre fonti. Non esitate a inviare commenti, suggerimenti o domande a noi a ciliate-curator@bradley. edu Cosa c'è di nuovo! ASCB Ciliate pranzo Il pranzo Ciliate in occasione della riunione 2015 UBCS a San Diego si terrà il 15 dicembre. Si prega di contattare Mark Winey (mark. winey (at) colorado. edu) se avete intenzione di partecipare a questo evento. 2016 Conference Biologia Molecolare Ciliato Il Ciliate Molecolare Conferenza Biology 2016 avverrà la prossima estate in un contesto nuovo entusiasmante che noi chiamiamo la Conferenza Genetica Totally Awesome (TAGC) che unirà per la prima volta, la maggior parte dei modelli incontri organismo GSA-sponsorizzati in una sola città, eseguiti in successione immediata. Questo è l'incontro Ciliate per il 2016, ma è molto, molto di più! L'incontro si terrà a Orlando, Florida, dal 13-17 LUGLIO presso il World Center Marriott, che fornisce un ambiente campus-come per impareggiabile rete. A Orlando troverete tariffe incredibili e voli nazionali e internazionali abbondanti e poco costosi. Abbiamo scelto questo luogo che può ospitare questo grande incontro, mantenendo i costi di partecipazione più basso possibile. Oltre al lavoro entusiasmante in ogni organismo, dottorandi anziani avranno l'opportunità di esplorare gli interessi post-dottorato in altri campi, dottori di ricerca avranno l'opportunità di rete con docenti provenienti da altre istituzioni, e tutti potranno godere di una ampiezza di prospettiva mai prima possibile in qualsiasi modello-organismo incontro si è focalizzato. In modo da portare i pantaloncini, occhiali da sole e infradito e incontrarci in Orlando questo mese di luglio. Organizer 2016 Conferenza Biologia Molecolare Ciliati 2015 Conference Biologia Molecolare Ciliato 2015 Biologia Molecolare Ciliato si terrà presso l'Università di Camerino (Camerino, Italia) dal 10 luglio - 16 luglio 2015. Informazioni sul luogo della riunione e un programma preliminare può essere trovato sul sito della conferenza. I modelli Gene Aggiornato I modelli di geni nel nostro database sono stati aggiornati in modo che corrisponda 2014 annotazioni prodotto da JCVI. Nelle prossime settimane ci sarà l'aggiunta nuovo dominio, omologo, GO, e altre annotazioni funzionali al sito sulla base dei nuovi modelli. Grazie a tutti per la pazienza mentre lavoriamo per migliorare il sito. Textpresso: Ricerca a testo integrale Abbiamo implementato Textpresso, il popolare strumento di text-mining sviluppata da Wormbase, a TGD Wiki. Textpresso per Tetrahymena. consente la ricerca di oltre 1700 documenti full-text utilizzando parole chiave e ricerche semantiche. Ulteriori documenti saranno aggiunti alla libreria in futuro. Tetrahymena annotazione Laboratorio Un numero limitato di aperture sono a disposizione per partecipare a un 2,5 giorni Tetrahymena laboratorio annotazione del genoma che si terrà presso il J. Craig Venter Institute di Rockville, MD (fuori Washington, DC) 7-9 luglio 2014. Il principale pubblico di destinazione sarà docenti interessati ad applicare strumenti web accessibile per l'annotazione gene strutturale e funzionale all'interno di un programma di ricerca e di formazione integrata. Il nostro obiettivo è quello di consentire docenti e studenti (soprattutto laureandi) di contribuire, in un modo piccolo o grande, per il miglioramento continuo delle annotazioni geniche disponibili attraverso il database Tetrahymena genoma. Facoltà dovrebbe essere impegnata a fornire alcune di queste opportunità in modo regolare base continuativa, sia in classi (genetica, biologia molecolare, bioinformatica, biologia cellulare, ecc) e / o attraverso progetti di ricerca indipendenti. Il workshop tratterà come pesare le varie forme di prove per fare previsioni di struttura del gene utilizzando l'interfaccia WebApollo e come fare le assegnazioni funzionali (i nomi di geni, andare termini, ecc) utilizzando le informazioni sui domini proteici e omologia. Ci sarà anche introdurre strumenti Gbrowse per il confronto delle macronuclear e micronuclear genomi e dei genomi macronuclear di T. thermophila e specie affini. Non è richiesta esperienza precedente con l'annotazione del genoma. I partecipanti devono prevede di arrivare entro il Domenica, 6 luglio e lasciando 9 luglio a sera, o più tardi. Tutte le spese standard, saranno coperti da un premio dalla National Science Foundation per ogni membro di facoltà e, se possibile, uno studente di accompagnamento (in aumento maggiore o minore), che può agire come assistente per una o più delle classi della facoltà e / o come un mentore per gli studenti in laboratorio. I membri di minoranze o facoltà sotto-rappresentate presso le istituzioni che servono tali popolazioni sono particolarmente incoraggiati ad applicare. Si prega di indirizzare tutte le richieste a uno degli organizzatori, elencati di seguito. Se si desidera applicare, si prega di inviare il vostro nome e informazioni di contatto e una breve descrizione di come soddisfare i vostri obiettivi di ricerca e istruzione potranno beneficiare di workshop a Bob Coyne, dal 25 aprile. Bob Coyne rcoyne a jcvi. org Nick Stover nstover a fsmail. bradley. edu Emily Wiley ewiley a kecksci. claremont. edu Tre nuove specie aggiunti Tre nuovi genomi sequenziati macronuclear Tetrahymena dal Broad Institute (T. malaccensis. T. Elliotti. E Borealis T.) sono stati aggiunti a TGD Wiki. Cerca queste sequenze in BLAST e GBrowse, o scaricarli dalla pagina Genome dati. I dati originali è possibile accedere in Tetrahymena Database comparativa del Broad. Le voci Pubmed Aggiornato TGD Wiki ha aggiornato le informazioni citazione di Pubmed per includere le carte dell'ultimo anno. Si prega di prendere un momento per annotare i geni menzionati in queste pubblicazioni nella sezione Riferimenti del gene pagina. Gene nomi estesi a quattro lettere Per aiutare a ospitare una più ampia varietà di nomi di geni, abbiamo aumentato di uno (da tre a quattro) il numero di lettere ha permesso di formare un prefisso Gene nome. I nomi sono stati in precedenza limitati al formato "ABC123". I nomi con la "ABCD123" formato saranno ora accettate. Si prega di notare che la lettera addizionale deve essere incluso prima dei numeri; lettere dopo i numeri (ad esempio "ABC123D") non sono attualmente accettate. Ci auguriamo che questa modifica al gene pubblicato denominazione linee guida aiuta con la spinta di nome come molti geni come possibile entro la fine del mese. SUPRDB raccoglie la ricerca inedita Lo studente / Inedito database di ricerca (SUPRDB, a suprdb. org) è stato istituito dalla Ciliate. org di accettare dati non pubblicati per aiutare nel l'annotazione del genoma Tetrahymena. SUPRDB iniziato come parte del Ciliati nel progetto Aula, ma incoraggiamo i contributi di tutti i membri della comunità di ricerca. I rapporti in formato scientifico standard possono essere inseriti nel sito. Il SUPRDB ID per il rapporto può quindi essere utilizzato come un ID Pubmed in sezioni GO annotazioni e Associated letteratura di TGD. Pensate a come PubMed Central per tutti i risultati inediti che abbiamo fatto nel corso degli anni. SUPRDB è l'ultima aggiunta alla famiglia Ciliate. org di siti web, che ora include i database genomici per Tetrahymena (tet. ciliate. org), Ichthyophthirius (ich. ciliate. org), e Oxytricha (oxy. ciliate. org). Per registrarsi per l'accesso in scrittura per uno di questi siti, contattaci all'indirizzo ciliate-curator@bradley. edu. Gene Naming Unità TGD Wiki e TETRA, Advisory Board Tetrahymena ricerca, incoraggiare tutti i membri della comunità di geni nome nella loro esperienza zona nel corso delle prossime settimane. Per contribuire a questo sforzo, abbiamo scritto una guida per la denominazione geni sulla base di semplici ricerche BLAST. I criteri sono semplici e dovrebbero permetterci di nominare rapidamente i geni conservati e famiglie di geni. Questa guida Naming Gene è pubblicato sotto il nostro menù Risorse, oppure è possibile accedervi in ​​basso. Naming geni utilizzando BLAST (PDF) Come promemoria, se hai pubblicato articoli con nomi nuovi geni, si prega di prendere un momento per aggiungere questi per TGD Wiki pure. Grazie per aver contribuito! giornale di New TGD Wiki Un nuovo articolo su TGD Wiki è stato pubblicato nella risorsa: The Journal of banche dati biologiche e Curation. Godere! 2013 Conference Biologia Molecolare FASEB Ciliato Si prega di segnare il tuo calendario! Il FASEB Ciliate Molecular Biology Conference 2013 si terrà 07-12 luglio 2013 presso la Steamboat Grand Resort (Steamboat Springs, Colorado). Informazioni sul luogo della conferenza può essere trovato sul sito web FASEB. Funzioni Sidebar La sezione Attività recente della barra laterale sinistra mostra ora le ultime tre pagine del gene a cura di membri della comunità, tra cui aggiornamenti di nomi di geni, andare annotazioni, e l'elenco dei documenti correlati. Documenti recenti mostra gli ultimi tre articoli aggiunti al nostro indice di carte Tetrahymena (scaricati regolarmente da Pubmed). Gli autori, si prega di prendere un momento per collegare nuove carte ai geni che descrivono. BLAST aggiornato Abbiamo aggiornato il server BLAST e la sua collezione di set di dati di sequenza. Il nuovo software BLAST è in grado di tradurre entrambe le sequenze di query e database utilizzando una varietà di codici genetici. (Si prega di notare che Tetrahymena utilizza il "Ciliate nucleare (6)" codice genetico di tradurre mRNA.) La proteina più recente (v.2008), CDS, Assemblaggio, e tracciare le sequenze sono attualmente disponibili per la ricerca. Per il momento, abbiamo anche un collegamento al server legacy BLAST a Stanford, che contiene le sequenze v.2004. Fateci sapere se si trova il nuovo server BLAST manca strumenti o gruppi di dati che hai trovato utile sul server legacy, che sarà presto dismesso. Collegamenti a TetraFGD La sezione Espressione del profilo di ogni pagina gene è stato aggiornato per il collegamento con il ridisegnato Tetrahymena genomica funzionale del database. TetraFGD mostra RNA-Seq, microarray, e profili di rete gene per T. thermophila geni. Preliminare del browser Ich sequenza del genoma L'annotazione preliminare del Ichthyophthirius multifiliis genoma è ora disponibile per la navigazione e la ricerca di parole chiave al browser ciliate. org genoma. Provvederemo ad aggiornare il sito con i nomi di geni ufficiali e modelli, una volta che sono stati finalizzati per la pubblicazione. Il browser genoma Ich è possibile accedere direttamente a http://ciliate. org/gb2/gbrowse/ich. Genome Browser aggiornato Il browser genoma è stato aggiornato per GBrowse 2 ed è ora che mostra l'annotazione v.2008 della sequenza del genoma Tetrahymena. Manterremo un link sulle pagine gene al browser v.2004 fino a quando siamo in grado di ricreare le tracce utili disponibili lì, ma si prega di notare che le sue sequenze e modelli di geni potrebbero non essere aggiornati. Le pagine gene TGD Wiki e il browser v.2008 entrambi mostrano la T. corrente thermophila annotazione. TGD Wiki si veste di nuovo! Il sito TGD Wiki è stato riprogettato. Non ti preoccupare, tutti i geni e strumenti preferiti sono ancora qui - ma ora dovrebbe essere ancora più piacevole lavorare su di loro! Grazie per questo aggiornamento si spengono al nostro nuovo programmatore Mike Bowen. Articolo su TGD Wiki Bradley University ha caratterizzato TGD Wiki, un progetto di collaborazione tra la biologia e dipartimenti di Computer Science, in un articolo Spotlight. Sono aperte le iscrizioni! ricercatori tetrahymena che desiderano contribuire allo sforzo della comunità di annotazione possono ora registrarsi e iniziare a modificare TGD Wiki. Basta inviare le informazioni richieste sulla pagina di registrazione utente per ciliato-curatore. Una volta che il laboratorio riceve un nome utente e una password, visitare il nuovo Modifica Guida Wiki per vedere quali tipi di annotazioni può essere fatto per i tuoi geni preferiti Tetrahymena. 2011 Conferenza FASEB Ha appena annunciato: The FASEB Ciliate Molecular Biology Conference 2011 si terrà presso l'Accademia ortodossa di Creta (Kolymvari, Chania, Grecia), a partire da luglio 11-15, 2011. I dettagli sono disponibili qui. riferimenti aggiornati Abbiamo caricato le informazioni citazione di Pubmed per le carte Tetrahymena pubblicati negli ultimi tre anni. Da questo punto in poi, TGD Wiki sarà aggiornato regolarmente per includere nuovi documenti che si rendono disponibili attraverso Pubmed. TGD Wiki è ora online! TGD Wiki è il nuovo hub per informazioni sui geni e le proteine ​​di Tetrahymena. TGD Wiki attualmente mostra le più recenti sequenze Tetrahymena gene / proteina e annotazioni funzionali di TIGR e da altre fonti. Al fine di mantenere le informazioni contenute nel nostro database più aggiornato possibile, ci sarà presto invitando i membri della comunità Tetrahymena per aggiungere e aggiornare queste annotazioni in modo da riflettere la ricerca pubblicata. Tornate qui per gli aggiornamenti, mentre continuiamo a sviluppare e migliorare questo sito web. TGD Wiki attualmente offre le seguenti caratteristiche: Libero, senza restrizioni l'accesso in lettura a tutti i dati disponibili dati di sequenza e annotazione di 24,725 geni (TIGR v.2008) GBrowse del browser genoma con collegamenti da e per ogni pagina gene (TIGR v.2006) BLAST ricerca dei modelli gene e genoma sequenza TIGR (TIGR v.2006) Ciliate. org pagine Wiki ™ Database Copyright Copyright & copy; 2016 Università di Bradley. Tutti i diritti riservati. 1501 occidentale Bradley Avenue, Peoria IL 61625 | (309) 676-7611 Link Wiki Link esterno Il permesso di utilizzare le informazioni contenute in questo database è stato inviato dai ricercatori / istituti che hanno contribuito o hanno pubblicato le informazioni. Gli utenti del database sono l'unico responsabile per il rispetto delle restrizioni di copyright, compresi quelli che riguardano gli abstract autore. I documenti di questo server sono forniti "così come sono" senza alcuna garanzia, espressa o implicita. Il progetto Ciliate. org alla Bradley University è supportata da una sovvenzione da parte del Centro Nazionale per la Ricerca Risorse, parte del National Institutes of Health.




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